安徽中醫(yī)藥大學(xué)創(chuàng)建于1959年,其前身為1952年創(chuàng)立的安徽省中醫(yī)進(jìn)修班(學(xué)校)。1959年,安徽省政府正式批準(zhǔn)成立安徽中醫(yī)學(xué)院,郭沫若先生題寫校名。1970年,安徽中醫(yī)學(xué)院并入安徽醫(yī)學(xué)院。1975年,國(guó)家教育部批準(zhǔn)恢復(fù)安徽中醫(yī)學(xué)院。2000年,安徽省醫(yī)藥學(xué)校并入安徽中醫(yī)學(xué)院。2011年,省政府批準(zhǔn)在安徽中醫(yī)學(xué)院的基礎(chǔ)上組建成立安徽省中醫(yī)藥科學(xué)院。2013年,教育部同意安徽中醫(yī)學(xué)院更名為安徽中醫(yī)藥大學(xué)。
"十二五"期間,學(xué)校將以鄧小平理論、"三個(gè)代表"重要思想和科學(xué)發(fā)展觀為指導(dǎo),堅(jiān)定中醫(yī)信念,弘揚(yáng)中醫(yī)精神,秉承"至精至誠(chéng)、惟是惟新"的理念,實(shí)施"質(zhì)量立校、人才興校、科技強(qiáng)校、特色弘校、文化塑校、和諧融校"的辦學(xué)方略,圍繞特色,強(qiáng)化優(yōu)勢(shì),提升質(zhì)量,著力培育"精誠(chéng)是新"中醫(yī)藥人才,構(gòu)筑安徽中醫(yī)藥協(xié)同創(chuàng)新高地,弘揚(yáng)"北華佗南新安"中醫(yī)藥文化,引領(lǐng)安徽中醫(yī)藥事業(yè)產(chǎn)業(yè)發(fā)展,建成富有特色、卓有貢獻(xiàn)、高水平有影響的安徽中醫(yī)藥大學(xué),為建設(shè)美好安徽、服務(wù)人民大眾健康做出更大貢獻(xiàn)。